Χρήση υπολογιστικών πόρων του πανεπιστημίου

[Thmmy.gr portal]

  Thmmy.gr portal
   Forum
   Downloads
   Ενεργ. Λογαριασμού
   Επικοινωνία
  
  Χρήσιμα links
   Σελίδα τμήματος
   Βιβλιοθήκη Τμήματος
   Elearning
   Φοιτητικά fora
   Πρόγραμμα Λέσχης
   Πρακτική Άσκηση
   Ηλεκτρονική Εξυπηρέτηση Φοιτητών
   Διανομή Συγγραμμάτων
   Ψηφιακό Καταθετήριο Διπλωματικών
   Πληροφορίες Καθηγητών
   Instagram @thmmy.gr
   mTHMMY
  
  Φοιτητικές Ομάδες
   ACM
   Aristurtle
   ART
   ASAT
   BEAM
   BEST Thessaloniki
   EESTEC LC Thessaloniki
   EΜΒ Auth
   IAESTE Thessaloniki
   IEEE φοιτητικό παράρτημα ΑΠΘ
   SpaceDot
   VROOM
   Panther
  

THMMY.gr Web

Helios_MultiScribbles2SMF Default ThemeSMFone_Blue

[Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads]

Είσαι πρωτοετής;... Καλώς ήρθες! Μπορείς να βρεις πληροφορίες εδώ. Βοήθεια για τους καινούργιους μέσω χάρτη.

Κατεβάστε εδώ το Android Application για εύκολη πρόσβαση στο forum.

Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads με προσοχή στα ονόματα των αρχείων!

Για ανανέωση (ή προσθήκη νέου) avatar, πρέπει η μεγαλύτερη διάσταση της εικόνας να είναι 110 pixels.

[princess_of_the_dawn]

Δε ξέρω πώς αλλιώς να το πώ. Ο σταθερός μου έχει για 1000οστή φορά θέμα με το σκληρό και το λάπτοπ μου είναι της πλάκας. Και χρειάζομαι ένα καλό πισι για να τρέξω δεδομένα σε μάτλαμπ. Έκανα απομακρυσμένη διασύνδεση σε υπολογιστή του ΑΠΘ αλλά έχει ματλαβ του 2003  . Υπάρχει κάποιος άλλος τρόπος να χρησιμοποιώ υπολογιστικούς πόρους του πανεπιστημίου για να κάνω τη δουλειά μου; Ή κάποια άλλη λύση;

[Niri]

Θα μπορουσες να χρησιμοποιησεις την υπολογιστικη συστοιχια του απθ.
Προσφερεται για απαιτητικες δουλειες και μπορει και να τρεχει προγραμματα παραλληλα σε πολλους υπολογιστες.

Το αρνητικο ειναι οτι συνδεεσαι μεσω terminal και μπορει να σου παρει αρκετη ωρα να συνηθισεις το πως δουλευει αν το κανεις για πρωτη φορα.

Αν βρεις καποια πιο ευκολη λυση σου προτεινω να επιλεξεις εκεινη. Αλλιως εδω υπαρχουν οδηγιες για το πως να χρησιμοποιησεις την συστοιχια για matlab.
https://it.auth.gr/el/sciComp/Computing-Services/manuals/matlab

[princess_of_the_dawn]

Εισ εσυ ένας Νίρι
Ευχαριστώ πολύ σήμερα κιόλας θα το προσπαθήσω και θα ενημερώσω

[princess_of_the_dawn]

Εισ εσυ ένας Νίρι
Ευχαριστώ πολύ σήμερα κιόλας θα το προσπαθήσω και θα ενημερώσω

Έχω κάνει αίτηση από το Σάββατο κι ακόμη να πάρω απάντηση. Τί φάση πόσο αργούνε βιάζομαιιιιι

[princess_of_the_dawn]

Θα μπορουσες να χρησιμοποιησεις την υπολογιστικη συστοιχια του απθ.
Προσφερεται για απαιτητικες δουλειες και μπορει και να τρεχει προγραμματα παραλληλα σε πολλους υπολογιστες.

Το αρνητικο ειναι οτι συνδεεσαι μεσω terminal και μπορει να σου παρει αρκετη ωρα να συνηθισεις το πως δουλευει αν το κανεις για πρωτη φορα.

Αν βρεις καποια πιο ευκολη λυση σου προτεινω να επιλεξεις εκεινη. Αλλιως εδω υπαρχουν οδηγιες για το πως να χρησιμοποιησεις την συστοιχια για matlab.
https://it.auth.gr/el/sciComp/Computing-Services/manuals/matlab

για να τρέξω τα αρχεία μου σε μάτλαμπ πρέπει να μεταφέρω όλα τα σκριπτς και τα αρχεία δεδομένων στο ματλαβ, σωστά;

[Vlassis]

για να τρέξω τα αρχεία μου σε μάτλαμπ πρέπει να μεταφέρω όλα τα σκριπτς και τα αρχεία δεδομένων στο ματλαβ, σωστά;

yeap να ειναι ολα στο path που τρεχεις στο matlab 

[princess_of_the_dawn]

αρχικά δε ξέρω τί μαλακίες έχω κάνει αλλά δε μπορώ να μεταφέρω αρχεία στο directory του σερβερ
https://it.auth.gr/el/scientific-computing-services/manuals/Win-2
μέχρι το 3 είμαι καλά αλλά όταν κάνω drag n drop τα αρχεία μου λέει permission is ντινάηντ

βοήθειααααααααααααααααααα

[Niri]

αρχικά δε ξέρω τί μαλακίες έχω κάνει αλλά δε μπορώ να μεταφέρω αρχεία στο directory του σερβερ
https://it.auth.gr/el/scientific-computing-services/manuals/Win-2
μέχρι το 3 είμαι καλά αλλά όταν κάνω drag n drop τα αρχεία μου λέει permission is ντινάηντ

βοήθειααααααααααααααααααα

Ισως να πρεπει να φτιαξεις τα permissions στον φακελο που το κανεις drag n drop.

Ισως να εχει και κανενα bug το winscp. Μια φορα που το ειχα χρησιμοποιησει μου προκαλεσε αρκετα προβληματα. Εγω παντα χρησιμοποιουσα το Filezilla για να κανω μεταφορα αρχειων παντως και δεν ειχα κανενα τετοιο προβλημα ποτε. Μπορεις να το δοκιμασεις και εσυ. Απλα μην ξεχασεις να βαλεις sftp:// στο url αντι για το απλο ftp://.

[johnvoyager]

εγώ είχα κάνει την δουλειά μου με αυτό :  MobaXterm  https://mobaxterm.mobatek.net/

[L]

εγώ είχα κάνει την δουλειά μου με αυτό :  MobaXterm  https://mobaxterm.mobatek.net/

+1

[princess_of_the_dawn]

Προς το παρόν το filezilla δουλεύει τζιτζιλόνι. Αν αντιμετωπίσω θέμα, θα πάω στο άλλο. Επίσης μείνετε συντονισμένες και συντονισμένοι όλο και κάποιο πρόβλημα θα έχω ωσονούπω.

[Niri]

Απλα να αναφερω ενα προβλημα που ισως να συναντησεις.

Οταν τρεχεις το matlab απο το terminal οπως αναφερεται στο βημα 2 του πρωτου link που εχω στειλει, τοτε το matlab τρεχει σε εναν υπολογιστη μεσαιων δυνατοτητων και μπορει για απαιτητικες εργασιες να μην μπορει να τις τρεξει.

Για απαιτητικες δουλειες χρειαζεται να υποβαλεις τον κωδικα να τρεξει στην συστοιχια οπως φαινεται απο το βημα 3 και κατω.

Δηλαδη το βημα 2 ειναι πιο πολυ για να δοκιμαζεις τον κωδικα σου αν τρεχει καλα και το βημα 3 και κατω για να τον εκτελεις.
Βεβαια αν δεν εχεις πολυ απαιτητικους υπολογισμους μπορεις να τα τρεχεις ολα οπως το βημα 2.

[princess_of_the_dawn]

ε εχουνε σπασει τα νεύρα μου. Λοιπόν γνκ οι εργασίες που θελω να τρέξω είναι χρονοβόρες και το λάπτοπ μου ειναι γτπ, το ντεσκτοπ εχει χαλασει και αν τις τρεξω στο λαπτοπ δε θα τελειωσω ουτε το 2020. Αυτό με την παράλληλη διεργασία πώς το κάνω; Στο βήμα 5 έχει ένα σκριπτ, αυτό που εχω σe πλαίσιο.Έγραψα 1-1 τις εντολες απο το σκριπτ όπου στο cd έδωσα το path απο το directory στο οποιο μετέφερα τα αρχεία μέσω  filezilla, τα οποία έιναι όλα τα σκριπτς που χρειαζομαι+ τα datasets που χρειάζομαι.

Στην ουσία όταν τρέχω κανονικό ματλαβ καλώ μία συνάρτηση(eeglab) η οποία ανοίγει ένα ui στο οποίο φορτώνω ένα dataset, έπειτα τρέχω ένα σκριπτ από το οποίο αποθηκεύω έναν πίνακα .mat και με βάση αυτόν τον .mat τρέχω μία άλλη συνάρτηση, τη χρονοβόρα. Αυτό πώς το κάνω στο terminal?

Δλδ οκ μεταφέρομαι στο directory που με ενδιαφέρει, ανοίγω το ματλαβ και μετά αν πάω να καλέσω τη συνάρτηση eeglab απλα μου λέει ότι δεν υπάρχει. Ντάξει είμαι άσχετη αλλά κι αυτοί το περίπλεξαν κάπως

#PBS -N MatlabParamJ
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=1:ppn=1
#PBS -t 1-4

#### CHANGE TO WORKDIR AND SET PATH ###
cd $PBS_O_WORKDIR
module load matlab

#### RUN MATLAB JOB ####
echo "Starting Matlab"
matlab -c $LM_LICENSE_FILE -nodisplay << EOF &> matlab.out

MyParameter = $PBS_ARRAYID
display(MyParameter)
myFunction(MyParameter)
save('myworkspace')
exit

exit
EOF

[Xplicit]

Δεν γνωρίζω και πολλά απο Matlab για να βοηθήσω. Νομίζω οτι υπάρχει όμως η δυνατότητα να ανοίξει το γραφικό περιβάλλον του matlab μέσω ssh. Χρειάζεται το X11 forwarding. Με linux είναι αρκετά εύκολο. Σε windows θα παιδευτείς σίγουρα περισσότερο. Δές αυτό το βιντεάκι μήπως σε βοηθήσει.
<a href="https://www.youtube.com/watch?v=QRsma2vkEQE" target="_blank">http://www.youtube.com/watch?v=QRsma2vkEQE</a>

[Niri]

Αρχικα πρεπει να ορισεις μια ουρα στο script.
Δηλαδη καπως ετσι:
#PBS -q oura
οπου αντι για oura βαζεις το ονομα ουρας που σου εχουν δωσει και μπορεις να χρησιμοποιεις. Νομιζω η κανονικη ουρα λεγοταν auth αλλα δεν ειμαι και σιγουρος.

Επιπλεον να εχεις υποψιν σου οτι για να υποβαλεις αρχεια για εκτελεση, τα αρχεια πρεπει να βρισκονται στο directory $SCRATCHDIR. Δηλαδη πρεπει να μπεις απο το filezilla στο $SCRATCHDIR που ειναι το /mnt/scratchdir/home/username και να βαλεις εκει τα αρχεια (οπου username ειναι το δικο σου username). (Η συστοιχια δεν μπορει δηλαδη να δει και να εκτελεσει τα αρχεια αν βρισκονται στο αρχικο directory που σε βγαζει οταν συνδεεσαι. Πρεπει να μπουν στο $SCRATCHDIR)

Θα σου συνιστουσα να προσπαθησεις αρχικα να τρεξεις ενα πολυ απλο προγραμματακι matlab για να δεις πως δουλευει και αν ειναι ολα ρυθμισμενα σωστα και μετα πας στα πιο πολυπλοκα.


Επισης δεν ξερω αν εγω δεν καταλαβα καλα τι γραφεις ομως τη συναρτηση eeglab  πρεπει να την καλεσεις μεσα απο το script και μετα να δωσεις την εντολη στο terminal:
qsub sript.pbs
Το βημα 2 δηλαδη που αναφερεται στο λινκ δεν εχει καμια σχεση με την εκτελεση κωδικα σε συστοιχια. Απλα ειναι για δικη σου διευκολυνση.