[Παράλληλα και Διανεμημένα Συστ.] Εργασία 2

[Thmmy.gr portal]

  Thmmy.gr portal
   Forum
   Downloads
   Ενεργ. Λογαριασμού
   Επικοινωνία
  
  Χρήσιμα links
   Σελίδα τμήματος
   Βιβλιοθήκη Τμήματος
   Elearning
   Φοιτητικά fora
   Πρόγραμμα Λέσχης
   Πρακτική Άσκηση
   Ηλεκτρονική Εξυπηρέτηση Φοιτητών
   Διανομή Συγγραμμάτων
   Ψηφιακό Καταθετήριο Διπλωματικών
   Πληροφορίες Καθηγητών
   Instagram @thmmy.gr
   mTHMMY
  
  Φοιτητικές Ομάδες
   ACM
   Aristurtle
   ART
   ASAT
   BEAM
   BEST Thessaloniki
   EESTEC LC Thessaloniki
   EΜΒ Auth
   IAESTE Thessaloniki
   IEEE φοιτητικό παράρτημα ΑΠΘ
   SpaceDot
   VROOM
   Panther
  

THMMY.gr Web

Helios_MultiScribbles2SMF Default ThemeSMFone_Blue

[Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads]

Είσαι πρωτοετής;... Καλώς ήρθες! Μπορείς να βρεις πληροφορίες εδώ. Βοήθεια για τους καινούργιους μέσω χάρτη.

Κατεβάστε εδώ το Android Application για εύκολη πρόσβαση στο forum.

Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads με προσοχή στα ονόματα των αρχείων!

[Admins]

Για αλλαγή του public name σας, επικοινωνήστε με έναν από τους Admins.

[ditroo]

όταν θέτετε Μ=Ν= 40000 σας τρέχει κανονικά στο hellas grid??
γιατί σε μένα στο game-of-life.log δεν εμφανίζεται κανένα μνμ και το μόνο που βγάζει είναι στο άλλο αρχείο το μνμ ότι δεν πρόλαβε να τελειώσει λόγω ορίου 120''.

[ReMi0s]

επειδή είχα το πρόβλημα αυτό, και δεν τελείωνε καν το generate_board μέσα στα 120 δευτερόλεπτα , έλεγξε αν στην generate την κάνεις στήλη στήλη αντί για σειρά σειρά.
Επίσης αν δεν έχεις υλοποιήσει OpenMp στην play, κάντο για να μειωθεί ο χρόνος εκτέλεσης.

[nikoscha]

Πως ορίζω το κάθε task να δημιουργήτε σε ξεχωριστό node? Ευχαριστώ εκ των προτέρων

[Terzos]

Έχει κανά 10λεπτο που έκανα qsub και το job μου είναι ακόμα στο queue
Το script που κάνω submit είναι αυτό:

Code:

#!/bin/bash
#PBS -N game-of-life
#PBS -q pdlab
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=4:ppn=5

module load mpi/mpich3-x86_64
cd $PBS_O_WORKDIR

echo "=====test Run starts now ======= `date` "

mpiexec -np $PBS_NP ./../bin/game-of-life 10 0.2 3 1 &> $PBS_JOBNAME.log

echo "====test Run ends now ======= `date` "

Έχει κανείς άλλος το ίδιο πρόβλημα;

[Terzos]

Πως ορίζω το κάθε task να δημιουργήτε σε ξεχωριστό node? Ευχαριστώ εκ των προτέρων

Επειδή δημιουργεί 1 task/processor εγώ χρησιμοποίησα την συνάρτηση MPI_Get_processor_name για να σταματήσω όλα πλην 1 task σε κάθε node σύμφωνα με την σελίδα 21 από εδώ: https://www.archer.ac.uk/training/course-material/2015/10/AdvMPI_EPCC/S1-L04-Split-Comms.pdf

[nikoscha]

Λογικά είναι θέμα του grid . To submit σωστό μου φαίνεται!

Έχει κανά 10λεπτο που έκανα qsub και το job μου είναι ακόμα στο queue
Το script που κάνω submit είναι αυτό:

Code:

#!/bin/bash
#PBS -N game-of-life
#PBS -q pdlab
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=4:ppn=5

module load mpi/mpich3-x86_64
cd $PBS_O_WORKDIR

echo "=====test Run starts now ======= `date` "

mpiexec -np $PBS_NP ./../bin/game-of-life 10 0.2 3 1 &> $PBS_JOBNAME.log

echo "====test Run ends now ======= `date` "

Έχει κανείς άλλος το ίδιο πρόβλημα;

[kaspas]

Στα 4 nodes ούτε εμένα έτρεχαν βάλε 3

[nikoscha]

Άμα βάλουμε 3 node όμως πως θα τρέχουμε 1 task/node για 4 tasks  και 80χ80 board?

Στα 4 nodes ούτε εμένα έτρεχαν βάλε 3

[kaspas]

Πάντως στην εκφώνηση δεν ζητάει task/node απλά processes λέει οπότε δεν πρέπει να χει θέμα αν τρέχουν 2 processes σε ενα node

[Exomag]

Πάντως στην εκφώνηση δεν ζητάει task/node απλά processes λέει οπότε δεν πρέπει να χει θέμα αν τρέχουν 2 processes σε ενα node

Γενικώς η λογική που ακολουθεί νομίζω είναι: "Όσο περισσότερα nodes γίνεται, τόσο καλύτερα. Από εκεί και πέρα (επειδή πολλά nodes δε σου δίνει το grid) πας με processes."

[kaspas]

Ναι ξέρει κανείς τι είναι ακριβώς το ppn ? Βάζω πχ node=3:ppn=1 και τρέχω για 4 processes έχω βάλει print και παίρνω :

Code:

Hi from process :3 from processor : wn031.grid.auth.gr
Hi from process :2 from processor : wn028.grid.auth.gr
Hi from process :1 from processor : wn029.grid.auth.gr
Hi from process :0 from processor : wn031.grid.auth.gr

[nikoscha]

Σωστά αλλά θα μπορεί να δεσμεύσει μνήμη ένα node για παράδειγμα 2 tasks?

Γενικώς η λογική που ακολουθεί νομίζω είναι: "Όσο περισσότερα nodes γίνεται, τόσο καλύτερα. Από εκεί και πέρα (επειδή πολλά nodes δε σου δίνει το grid) πας με processes."

[Exomag]

Σωστά αλλά θα μπορεί να δεσμεύσει μνήμη ένα node για παράδειγμα 2 tasks?

Υποθέτω πως αν ζητήσεις πολύ πράμα να δεσμευτεί να μην μπορέσει, όντως. Για αυτόν τον λόγο και ιδανικά θα καλούσες όσα nodes χρειαζόσουν, αλλά επειδή πολλά nodes δε σου δίνει το grid, αναγκάζεσαι να κάνεις "εκπτώσεις" και να το γυρνάς σε processes.

[Aristos]

Ναι ξέρει κανείς τι είναι ακριβώς το ppn ?

έχω την εντύπωση πως σημαίνει proccessor per node. καθε node έχει πολλούς πυρήνες. με αυτήν την επιλογή διαλέγεις πόσους θα χρησιμοποιήσεις στο κάθε μηχάνημα

[Gtaliou]

Το ppn σημαινει process per node οπότε ο συνολικός αριθμός των processes είναι nodes * ppn. Στην εκφώνηση ζητάει 1,2 και 4 διεργασίες. Δεν νομίζω ότι μπορούμε να βάζουμε random νουμερα.