[Παράλληλα και Διανεμημένα Συστ.] Εργασία 2

[Thmmy.gr portal]

  Thmmy.gr portal
   Forum
   Downloads
   Ενεργ. Λογαριασμού
   Επικοινωνία
  
  Χρήσιμα links
   Σελίδα τμήματος
   Βιβλιοθήκη Τμήματος
   Elearning
   Φοιτητικά fora
   Πρόγραμμα Λέσχης
   Πρακτική Άσκηση
   Ηλεκτρονική Εξυπηρέτηση Φοιτητών
   Διανομή Συγγραμμάτων
   Ψηφιακό Καταθετήριο Διπλωματικών
   Πληροφορίες Καθηγητών
   Instagram @thmmy.gr
   mTHMMY
  
  Φοιτητικές Ομάδες
   ACM
   Aristurtle
   ART
   ASAT
   BEAM
   BEST Thessaloniki
   EESTEC LC Thessaloniki
   EΜΒ Auth
   IAESTE Thessaloniki
   IEEE φοιτητικό παράρτημα ΑΠΘ
   SpaceDot
   VROOM
   Panther
  

THMMY.gr Web

Helios_MultiScribbles2SMF Default ThemeSMFone_Blue

[Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads]

Είσαι πρωτοετής;... Καλώς ήρθες! Μπορείς να βρεις πληροφορίες εδώ. Βοήθεια για τους καινούργιους μέσω χάρτη.

Κατεβάστε εδώ το Android Application για εύκολη πρόσβαση στο forum.

Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads με προσοχή στα ονόματα των αρχείων!

[Πληροφορίες Καθηγητών]

Πληροφορίες Καθηγητών

[ReMi0s]

Προσπαθώ να τρέξω στο hellas grid αλλα μου βγάζει error
=>> PBS: job killed: walltime 158 exceeded limit 120
ξέρει κανείς τπτ για αυτό;

[Andromedas]

Προσπαθώ να τρέξω στο hellas grid αλλα μου βγάζει error
=>> PBS: job killed: walltime 158 exceeded limit 120
ξέρει κανείς τπτ για αυτό;

νομίζω είναι ο default επιτρεπτός χρόνος 120 sec. Εάν κάνει παραπάνω γίνεται kill η εργασία. Δεν είμαι 100% σίγουρος, τσεκαρε να ρίξεις τον αριθμό των κελιών για να κάνεις λιγότερο χρόνο.

[Ancient]

Δε χρειάζεται (και δε πρέπει) να "επιστρέψει" το σύνολο του πίνακα στη master διεργασία...

[ReMi0s]

Δε χρειάζεται (και δε πρέπει) να "επιστρέψει" το σύνολο του πίνακα στη master διεργασία...

Δεν το επιστρέφω σε καμία διεργασία.
Το πρόγραμμα δεν τρέχει για 40000Χ40000 για μια διεργασια που ζητάει, γενικα για τέτοια νούμερα πρέπει να ανεβάσω τον αριθμό των nodes.
Σε σας τρέχει για τέτοια νούμερα και μια διεργασία;

[BADBANE]

Δεν έχω καταλάβει την συσχετιση nodes και ppn με τον αριθμο των διεργασιών που πρέπει να δημιουργήσουμε...  Πως ακριβώς παει; Για δημιουργια 1, 2 και 4 διεργασιών που ζητάει το προβλημα τι πρέπει να βάλω στο script?

edit: nodes*ppn απ' ότι ειδα σωστά ?

[ReMi0s]

Δεν έχω καταλάβει την συσχετιση nodes και ppn με τον αριθμο των διεργασιών που πρέπει να δημιουργήσουμε...  Πως ακριβώς παει; Για δημιουργια 1, 2 και 4 διεργασιών που ζητάει το προβλημα τι πρέπει να βάλω στο script?

edit: nodes*ppn απ' ότι ειδα σωστά ?

χωρίς να είμαι απόλυτα σίγουρος
node=άλλος υπολογιστής
ppn =αλλος επεξεργαστής

έτσι αν βάλεις 2 node και 2 ppn θα τρέξει σε 2 "υπολογιστές" και στον καθένα θα τρέξουν 2 διεργασίες. Σύνολο 4

[kaspas]

χωρίς να είμαι απόλυτα σίγουρος
node=άλλος υπολογιστής
ppn =αλλος επεξεργαστής

έτσι αν βάλεις 2 node και 2 ppn θα τρέξει σε 2 "υπολογιστές" και στον καθένα θα τρέξουν 2 διεργασίες. Σύνολο 4

Δηλαδή εφόσον χρησιμοποιούμε και openmp καλύτερα να βάλουμε τα processes σε διαφορετικά nodes;

[ReMi0s]

Δηλαδή εφόσον χρησιμοποιούμε και openmp καλύτερα να βάλουμε τα processes σε διαφορετικά nodes;

Λογικά ναι, θα πάρεις καλύτερο αποτέλεσμα αν καθε ένα node τρέχει μια διεργασία, όσον αφορά το OpenMp.
Αλλά ο κυριότερος λόγος για να χρησιμοποιήσεις άλλο node είναι η μνήμη .

[Andromedas]

Η επικοινωνία μεταξύ των nodes  συνήθως είναι πιο χρονοβόρα αντί σε διεργασίες σε ένα node.

[ReMi0s]

Τελικά έχει καταφέρει κανείς να τρέξει το πρόγραμμα για τα νούμερα που ζητάει;
Εμένα δεν τρέχει πχ για 40000*40000 και μία διεργασία, ενώ τρέχει για 39999*39999

[fanaks]

Προσπαθώ να τρέξω στο hellas grid αλλα μου βγάζει error
=>> PBS: job killed: walltime 158 exceeded limit 120
ξέρει κανείς τπτ για αυτό;

+1
Έχει βρει μήπως κάποιος τι παίζει?

[Andromedas]

Ναι ρώτησα τον Φλώρο. Είναι χρόνος τερματισμού δεν σε αφήνει πάνω από δυο λεπτά να τρέξει και δεν μπορούμε να το αλλάξουμε εμείς. Γενικά ειπέ ότι πρεπεί να είναι κάτω από 2 λεπτά...

[ReMi0s]

Εγώ πάντως είδα οτι για 40000*40000 που ζητάει μόνο το init+generate παίρνει πάνω απο 120 δευτερόλεπτα. Δεν μπαίνει οπότε ουτε καν στην play.
Και το γαμάτο είναι οτι δεν μπορείς να πειράξεις με OpenMp την generate, η τουλάχιστον εγώ δεν το κατάφερα να μου δώσει καλύτερους χρόνους...

Αλήθεια είναι κανείς που έκανε την Generate να δίνει καλύτερους χρόνους;

Τελικά κατάφερα να το τρέξω για 40000*40000 , είχα κάνει λάθος στην generate και αντί να γεμίζει τον πίνακα μια μια γραμμή, τον γέμμιζε μια μια στήλη. Δεν ξέρω για ποιο λόγο  αλλα το αποτέλεσμα ήταν ΠΟΛΥ χειρότερο έτσι, ενώ στην ουσία κάνει τον ίδιο αριθμό πράξεων.
Για όσους ίσως έχουν παρόμοιο πρόβλημα.

[Terzos]

Προσπαθώ να χρησιμοποιήσω την συνάρτηση MPI_Comm_split_type για να χωρίσω τον communicator σε groups με το ίδιο node σύμφωνα με αυτό: https://cvw.cac.cornell.edu/mpiadvtopics/splitting
Όταν πάω να κάνω compile παίρνω το εξής:
hello-MPI.c:23: error: ‘MPI_COMM_TYPE_SHARED’ undeclared (first use in this function)
hello-MPI.c:23: error: (Each undeclared identifier is reported only once
hello-MPI.c:23: error: for each function it appears in.)

Μήπως δεν υποστηρίζονται οι εντολές MPI-3;

[Andromedas]

hello-MPI.c:23: error: ‘MPI_COMM_TYPE_SHARED’ undeclared (first use in this function)

κάνεις include mph.h φαντάζομαι ;

/εδιτ με αυτό πάντως πώς θα κάνεις τις διαγώνιες επικοινωνίες ; το ρωτάω γιατί προσπάθησα με cart και δεν έβγαλα ακρή  
/εδιτ2
και δεν βρήκα τον τύπο MPI_Comm_split που βλεπώ στο link

https://cvw.cac.cornell.edu/mpiadvtopics/splitting

  που λες στην έκδοση 3.1 MPICH
https://www.mpich.org/static/docs/v3.1/www3/MPI_Comm_split.html