[Παράλληλα και Διανεμημένα Συστ.] Εργασία 1

[Thmmy.gr portal]

  Thmmy.gr portal
   Forum
   Downloads
   Ενεργ. Λογαριασμού
   Επικοινωνία
  
  Χρήσιμα links
   Σελίδα τμήματος
   Βιβλιοθήκη Τμήματος
   Elearning
   Φοιτητικά fora
   Πρόγραμμα Λέσχης
   Πρακτική Άσκηση
   Ηλεκτρονική Εξυπηρέτηση Φοιτητών
   Διανομή Συγγραμμάτων
   Ψηφιακό Καταθετήριο Διπλωματικών
   Πληροφορίες Καθηγητών
   Instagram @thmmy.gr
   mTHMMY
  
  Φοιτητικές Ομάδες
   ACM
   Aristurtle
   ART
   ASAT
   BEAM
   BEST Thessaloniki
   EESTEC LC Thessaloniki
   EΜΒ Auth
   IAESTE Thessaloniki
   IEEE φοιτητικό παράρτημα ΑΠΘ
   SpaceDot
   VROOM
   Panther
  

THMMY.gr Web

Helios_MultiScribbles2SMF Default ThemeSMFone_Blue

[Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads]

Είσαι πρωτοετής;... Καλώς ήρθες! Μπορείς να βρεις πληροφορίες εδώ. Βοήθεια για τους καινούργιους μέσω χάρτη.

Κατεβάστε εδώ το Android Application για εύκολη πρόσβαση στο forum.

Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads με προσοχή στα ονόματα των αρχείων!

[Δείτε περισσότερα εδώ...]

Συμβουλές καλής χρήσης του φόρουμ: Youtube embed code and links, Shoutbox, Notify, ...

Δείτε περισσότερα εδώ...

[nikoscha]

Την radix sort με pthreads την κανατε για σταθερο αριθμο threads η μεταβαλλόμενο  ?

[Delaney]

στο makefile το μονο που εβαλα για να τρεξει, και ετρεχε στο διαδη κανονικα ηταν να βαλω πρωτη γραμμη αντικατασταση σε οτι εχει με αυτο:

Code:

GCC=icc -lcilkrts -ldl -O3 -std=gnu99

Μια ακομα βοηθεια, γιατι ειμαι ασχετος με Ματλαμπ.. Με το τρεξιμο της run_tests δημιουργειται ενα αρχειο με χρονους που παιρνουμε.. Αυτους τους χρονους πως τους περναμε στη Ματλαμπ για να παρουμε τους χρονους? Εχω χασει αρκετο χρονο και δεν εχω βγαλει ακρη ακομα για να παρω τα διαγραμματα εστω για την openMP..

[Insignia]

Μια ακομα βοηθεια, γιατι ειμαι ασχετος με Ματλαμπ.. Με το τρεξιμο της run_tests δημιουργειται ενα αρχειο με χρονους που παιρνουμε.. Αυτους τους χρονους πως τους περναμε στη Ματλαμπ για να παρουμε τους χρονους? Εχω χασει αρκετο χρονο και δεν εχω βγαλει ακρη ακομα για να παρω τα διαγραμματα εστω για την openMP..

Χρησιμοποιείς το αρχείο read_data.m. Το βάζεις στο current folder της matlab (εκεί που δείχνει το path πάνω από το command window) και γράφεις στο command windows την εντολή results=read_data('onoma_arxeiou.txt', 3, ...). Φυσικά χρειάζεται να κάνεις κάποιες αλλαγές στο αρχείο αλλά οι αλλαγές είναι πολύ λίγες. Κυρίως χρειάζεται να παίξεις με την reshape που αλλάζει τις διαστάσεις του πίνακα.
Επίσης αν τρέχεις τη matlab σε windows τότε η εντολή grep δεν θα δουλέψει γιατί ειναι εντολή για linux. Αντί αυτής της εντολής χρησιμοποίησε την εντολή findstr οπότε ολόκληρη η πρώτη εντολή θα γίνει κάπως έτσι:
system(sprintf('findstr /C:"Time to compute the hash codes" %s > hash.txt', src));

[unfo]

Χρησιμοποιείς το αρχείο read_data.m. Το βάζεις στο current folder της matlab (εκεί που δείχνει το path πάνω από το command window) και γράφεις στο command windows την εντολή results=read_data('onoma_arxeiou.txt', 3, ...). Φυσικά χρειάζεται να κάνεις κάποιες αλλαγές στο αρχείο αλλά οι αλλαγές είναι πολύ λίγες. Κυρίως χρειάζεται να παίξεις με την reshape που αλλάζει τις διαστάσεις του πίνακα.
Επίσης αν τρέχεις τη matlab σε windows τότε η εντολή grep δεν θα δουλέψει γιατί ειναι εντολή για linux. Αντί αυτής της εντολής χρησιμοποίησε την εντολή findstr οπότε ολόκληρη η πρώτη εντολή θα γίνει κάπως έτσι:
system(sprintf('findstr /C:"Time to compute the hash codes" %s > hash.txt', src));

Επειδη εχω και εγω το ιδιο προβλημα και δεν μπορω να παρω διαγραμματα,βαζω στο command line result=read_data('arxeio.txt', 18, 128,  2^21, επαναληψεις) και δεν μου δουλευει! Επισης δεν εχω καταλαβει τι αλλαγες πρεπει να κανω στο read_data.m

[Insignia]

Επειδη εχω και εγω το ιδιο προβλημα και δεν μπορω να παρω διαγραμματα,βαζω στο command line result=read_data('arxeio.txt', 18, 128,  2^21, επαναληψεις) και δεν μου δουλευει! Επισης δεν εχω καταλαβει τι αλλαγες πρεπει να κανω στο read_data.m

Σαν παραμέτρους βάζεις τον αριθμό των διαφορετικών tree height, population thresholds και points που δοκίμασες, δηλαδή 1 στην περίπτωσή σου.
Οι αλλαγές που πρέπει να κάνεις είναι πρακτικά στο reshape. Δηλαδή οι διάφοροι χρόνοι μπαίνουν σε ένα πίνακα μιας διάστασης και εσύ με το reshape τον φτιάχνεις έτσι ώστε στις στήλες να μπούν οι επαναλήψεις που έχεις κάνει για κάθε point και thread έτσι ώστε να πάρεις τον μέσο όρο. Επίσης, αν με το script μετρας χρόνους και για διάφορα threads τότε πρέπει να φτιάξεις το reshape κατάλληλα για να αλλάζει τις διαστάσεις του πίνακα ανάλογα με τον αριθμό των διαφορετικών threads που μετράς.

[stan14]

Παιδια ξερει κανεις πως περναω φακελους στο diades απο cygwin?

[Nerevar]

Βάλτε Filezilla..

[Insignia]

Παιδια ξερει κανεις πως περναω φακελους στο diades απο cygwin?

Συμφωνώ και εγώ να βάλεις filezilla.
Αν παρόλα αυτά θες να χρησιμοποιήσεις το cygwin τότε πρώτα απ' όλα πρέπει να εγκαταστήσεις το πακέτο που λέγεται openssh με τον ίδιο τρόπο που εγκατέστησες και τους compiler τρέχοντας το αρχείο setup. Μετά βάζεις την εντολή
scp -P 2288 -r /home/toonomasou/fakelos/ toonomasou@diades.ee.auth.gr:/export/home/toonomasou/

Απλά να έχεις υπόψιν σου οτι ο diades είναι πεσμένος αυτή τη στιγμή.

[amastron]

Η 1η εργασία παίρνει παράταση μίας εβδομάδας, μέχρι Κυριακή 27 Νοεμβρίου 23:55.   Aπό elearning.

[Vlassis]

Η 1η εργασία παίρνει παράταση μίας εβδομάδας, μέχρι Κυριακή 27 Νοεμβρίου 23:55.   Aπό elearning.

ΓΙΕΕΕΕΣΣΣΣ 

[nikoscha]

Σε cilk πως οριζω τον αριθμο των threads??

[Ancient]

Σε cilk πως οριζω τον αριθμο των threads??

 Με τη συνάρτηση __cilk_set_param("nworkers",nthreads).   Αλλά το nthreads πρέπει να είναι string.

[Delaney]

Σαν παραμέτρους βάζεις τον αριθμό των διαφορετικών tree height, population thresholds και points που δοκίμασες, δηλαδή 1 στην περίπτωσή σου.
Οι αλλαγές που πρέπει να κάνεις είναι πρακτικά στο reshape. Δηλαδή οι διάφοροι χρόνοι μπαίνουν σε ένα πίνακα μιας διάστασης και εσύ με το reshape τον φτιάχνεις έτσι ώστε στις στήλες να μπούν οι επαναλήψεις που έχεις κάνει για κάθε point και thread έτσι ώστε να πάρεις τον μέσο όρο. Επίσης, αν με το script μετρας χρόνους και για διάφορα threads τότε πρέπει να φτιάξεις το reshape κατάλληλα για να αλλάζει τις διαστάσεις του πίνακα ανάλογα με τον αριθμό των διαφορετικών threads που μετράς.

Ευχαριστω για την απαντηση! Εχω αλλο προβλημα τωρα.. Βαζοντας κανονικα τη γραμμη result=read_data κτλ κτλ, χτυπαει η Matlab στο reshape και ενω εχω δοκιμασει διαφορα, το error δε λεει να φυγει.. Και γενικα επαιξα με τα nP,nL, κτλ, αλλα δεν ξερω τι δεν κανω.. Αν καποιου του εχει βγει και μπορει να μας διαφωτισει, θα εκτιμηθει δεοντως. Ενα καφεδακι στο κυλικειο ας πουμε  

Τα errors ειναι τα παρακατω:
Error using reshape
To RESHAPE the number of elements must not change.

Error in read_data (line 32)
hash_mean = reshape(hash_mean, 2, 2, 2);

[Vlassis]

στα pthreads μέσα στην radix_sort η παρακατω εντολη

Code:

 unsigned long int *morton_codes = my_data->morton_codes;

μου πεταει το error

Code:

dereferencing pointer to incomplete type ‘struct thread_data’
     unsigned long int *morton_codes = my_data->morton_codes;
                                              ^

παιζει να το εχει δει κανεις αλλος αυτο;
(πολυ πιθανον να κανω και βλακειες, εχω καταμπερδευτει με αυτο το πραγμα)

άκυρο, εβαλα την δήλωση της δομής μέσα στο .h και λύθηκε  

[Insignia]

Ευχαριστω για την απαντηση! Εχω αλλο προβλημα τωρα.. Βαζοντας κανονικα τη γραμμη result=read_data κτλ κτλ, χτυπαει η Matlab στο reshape και ενω εχω δοκιμασει διαφορα, το error δε λεει να φυγει.. Και γενικα επαιξα με τα nP,nL, κτλ, αλλα δεν ξερω τι δεν κανω.. Αν καποιου του εχει βγει και μπορει να μας διαφωτισει, θα εκτιμηθει δεοντως. Ενα καφεδακι στο κυλικειο ας πουμε  

Τα errors ειναι τα παρακατω:
Error using reshape
To RESHAPE the number of elements must not change.

Error in read_data (line 32)
hash_mean = reshape(hash_mean, 2, 2, 2);

Αυτό το πρόβλημα στο βγάζει επειδή οι καινούργειες διαστάσεις του πίνακα δεν είναι συμβατές με τις παλιές (πχ προσπαθεις να κάνεις ενα πίνακα 1x4 σε 3x2).
Αυτό πιθανότατα στο βγάζει επειδή αυτή η συνάρτηση read_data έχει φτιαχτεί για να δέχεται μονο διαφορετικό αριθμό tree heights, population threshold, number of points και αριθμού repetitions. Ενώ εσύ το έχεις τρέξει και για διαφορετικό αριθμό threads.
Αυτό που έχεις να κάνεις είναι απλά να βάλεις να δέχεται άλλη μια παράμετρο όπου θα εισάγεις τον αριθμό των διαφορετικών threads που έχεις τεστάρει και θα το βάλεις στις reshape κατάλληλα.