[Παράλληλα και Διανεμημένα Συστ.] Εργασια 4

[Thmmy.gr portal]

  Thmmy.gr portal
   Forum
   Downloads
   Ενεργ. Λογαριασμού
   Επικοινωνία
  
  Χρήσιμα links
   Σελίδα τμήματος
   Βιβλιοθήκη Τμήματος
   Elearning
   Φοιτητικά fora
   Πρόγραμμα Λέσχης
   Πρακτική Άσκηση
   Ηλεκτρονική Εξυπηρέτηση Φοιτητών
   Διανομή Συγγραμμάτων
   Ψηφιακό Καταθετήριο Διπλωματικών
   Πληροφορίες Καθηγητών
   Instagram @thmmy.gr
   mTHMMY
  
  Φοιτητικές Ομάδες
   ACM
   Aristurtle
   ART
   ASAT
   BEAM
   BEST Thessaloniki
   EESTEC LC Thessaloniki
   EΜΒ Auth
   IAESTE Thessaloniki
   IEEE φοιτητικό παράρτημα ΑΠΘ
   SpaceDot
   VROOM
   Panther
  

THMMY.gr Web

Helios_MultiScribbles2SMF Default ThemeSMFone_Blue

[Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads]

Είσαι πρωτοετής;... Καλώς ήρθες! Μπορείς να βρεις πληροφορίες εδώ. Βοήθεια για τους καινούργιους μέσω χάρτη.

Κατεβάστε εδώ το Android Application για εύκολη πρόσβαση στο forum.

Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads με προσοχή στα ονόματα των αρχείων!

Για ανανέωση (ή προσθήκη νέου) avatar, πρέπει η μεγαλύτερη διάσταση της εικόνας να είναι 110 pixels.

[greekoo]

Επισης με αυτο τον τροπο
Σαν προσθήκη σε όσα είπε ο Ανδρομέδας, δοκίμασε αν γίνεται να κάνεις compile σε object file το cuda αρχείο σου, και να κάνεις απλά link στο mpcc το object. Θα χρειαστείς φυσικά τα function declarations του cuda kernel σε header file.

 τρεχει τζαμι στον διαδη

Εμένα δεν τρέχει φίλε

Αν κατάλαβα καλά ουσιαστικά είναι σαν τις οδηγίες εδώ:
https://www.ccv.brown.edu/doc/mixing-mpi-and-cuda.html

Aλλά παρόλαυτά στο τελευταίο βήμα δεν μου βρίσκει το lcudart για να κάνω το linking!!

[weiss]

Νομίζω σκέτο δε τρέχει. Δοκίμασε -lcudart -L/usr/local/cuda/lib64

[nikos1]

Αναλυτικα οι οδηγιες στο συννημενο για MPI-CUDA

[greekoo]

Αναλυτικα οι οδηγιες στο συννημενο για MPI-CUDA

Τώρα μάλιστα φίλε να σαι καλά 

Είδα σε ένα ποστ του Πιτσιάνη στο ethmmy ότι έχουν μηχάνημα με 4 GPUS. Εννοεί τον διάδη έτσι; 

Δηλαδή αν κάνω mpirun στον διάδη με 4 nodes/tasks , θα ενεργοποιηθούν οι 4 gpus (μια σε κάθε Node) άραγε;

[nikos1]

Τώρα μάλιστα φίλε να σαι καλά 

Είδα σε ένα ποστ του Πιτσιάνη στο ethmmy ότι έχουν μηχάνημα με 4 GPUS. Εννοεί τον διάδη έτσι; 

Δηλαδή αν κάνω mpirun στον διάδη με 4 nodes/tasks , θα ενεργοποιηθούν οι 4 gpus (μια σε κάθε Node) άραγε;

Οχι πρεπει να ειναι αλλο μηχανημα... πρεπει να επικοινωνησουμε μαζι του για να μας δωσει κωδικο

[Andromedas]

Τώρα μάλιστα φίλε να σαι καλά 

Είδα σε ένα ποστ του Πιτσιάνη στο ethmmy ότι έχουν μηχάνημα με 4 GPUS. Εννοεί τον διάδη έτσι; 

Δηλαδή αν κάνω mpirun στον διάδη με 4 nodes/tasks , θα ενεργοποιηθούν οι 4 gpus (μια σε κάθε Node) άραγε;

Μάλλον όχι. Με το mpi run θα έχεις 4 processes να τρέχουν και να δίνουν στο device (μια κάρτα γραφικών) που έχεις προσδιορίσει στον κώδικα της cuda. Αν δεν το έχεις κάνεις θα δώσει αυτόματα σε ένα  device αλλά δεν νομίζω ότι μπορεί το λειτουργικό να διακρίνει εάν είναι απασχολημένη η μια gpu να δίνει στην επόμενη από μόνο του εντελώς.

[greekoo]

παιδιά όσο για το hellasgrid τσάμπα προσπαθούμε να τρέξουμε mpi+cuda.

έστειλα μαιλ να ρωτήσω αν γίνεται κ αυτό μ απάντησαν:

δυστυχώς δεν μπορεί να εξυπηρετηθεί το αίτημά σας από τους υφιστάμενους πόρους καθότι στην συστοιχία της Αφροδίτης που χρησιμοποιείτε δεν υπάρχει ο απαραίτητος εξοπλισμός από GPUs.

Στην Ιδρυματική συστοιχία που επίσης μπορείτε να χρησιμοποιήσετε υπάρχει μόνο μία GPU οπότε και πάλι δεν γίνεται να εξυπηρετηθεί το αίτημα παρά μόνο για την περίπτωση όπου ένα από τα τέσσερα mpi processes χρησιμοποιεί την GPU.

Θα διατηρήσουμε σε κάθε περίπτωση το αίτημά σας ώστε στο σχεδιασμό μας για την ανανέωση του εξοπλισμού να ληφθεί υπόψιν. Αν θα μπορούσατε από τη μεριά σας να μας κοινοποιήσετε μία επιστολή υπογεγραμμένη από μέλος ΔΕΠ του ΑΠΘ όπου να περιγράφεται εν συντομία το use case και να υπογραμμίζεται η ανάγκη ύπαρξης μίας απαραίτητης υποδομής GPU τότε αυτό θα μας διευκόλυνε στο να περάσουμε το αίτημα στον προγραμματισμό μας.

[TrueForce]

Θα διατηρήσουμε σε κάθε περίπτωση το αίτημά σας ώστε στο σχεδιασμό μας για την ανανέωση του εξοπλισμού να ληφθεί υπόψιν. Αν θα μπορούσατε από τη μεριά σας να μας κοινοποιήσετε μία επιστολή υπογεγραμμένη από μέλος ΔΕΠ του ΑΠΘ όπου να περιγράφεται εν συντομία το use case και να υπογραμμίζεται η ανάγκη ύπαρξης μίας απαραίτητης υποδομής GPU τότε αυτό θα μας διευκόλυνε στο να περάσουμε το αίτημα στον προγραμματισμό μας.

Αυτο γενικά σημαίνει πως δεν παίζει να προλάβετε εσείς μια τέτοια υποδομή, αλλά καλό θα ήταν να γίνει κάποια κίνηση σε περίπτωση που παίξει κάποια μελλοντική αλλαγή.

ΝΟΜΙΖΩ πως πέρσι και πρόπερσι που είχε την επιλογή για εργασία με Deep Learning είχε αναφερθεί πως έπρεπε να στείλεις mail αν πάρεις αυτό το θέμα ώστε να σου δοθεί πρόσβαση σε σερβερ με 4 GPU, φαντάζομαι ΟΧΙ στο hellasgrid. Δε θυμάμαι αν έχει κάτι τέτοιο ο διάδης, παίζει.... Με ένα email στον Πιτσιάνη νομίζω θα βρείτε τη φώτιση για το θέμα. Πέρσι που του είχα στείλει mail είχε απαντήσει ακόμα και τέτοια εποχή(λίγο πριν δεκαπεντάγουστο) οπότε μη μασάτε.

[Λήσταρχος Γιαγκούλας]

Kαλησπέρα , γνωρίζει κάποιος πως μπορούμε να κάνουμε submit-qsub χρησιμοποιώντας αντί για απλά arguments του του τύπου

export I2G_MPI_APPLICATION_ARGS= "χ υ ζ"

ένα αρχείο .par με παραμέτρους ;

κάτι σαν
export I2G_MPI_APPLICATION_ARGS= χχχχχχ.par

[nlogn]

Kαλησπέρα , γνωρίζει κάποιος πως μπορούμε να κάνουμε submit-qsub χρησιμοποιώντας αντί για απλά arguments του του τύπου

export I2G_MPI_APPLICATION_ARGS= "χ υ ζ"

ένα αρχείο .par με παραμέτρους ;

κάτι σαν
export I2G_MPI_APPLICATION_ARGS= χχχχχχ.par

Μπορείς να μας δείξεις το αρχείο τύπου par που έχεις?

[nlogn]

Αν το αρχείο σου είναι του τύπου:
A = 1
B = 2
G 123

τότε η εντολές με την ακοόλουθη σειρά:

Code:

temp=`cat my_par.par`
temp=`echo $temp | tr '\n' ' '`
export I2G_MPI_APPLICATION_ARGS=$temp

θα κάνουν μια
I2G_MPI_APPLICATION_ARGS='A = 1 B = 2 G 123'

Ελπίζω να σε βοήθησα

[Λήσταρχος Γιαγκούλας]

Αν το αρχείο σου είναι του τύπου:
A = 1
B = 2
G 123

τότε η εντολές με την ακοόλουθη σειρά:

Code:

temp=`cat my_par.par`
temp=`echo $temp | tr '\n' ' '`
export I2G_MPI_APPLICATION_ARGS=$temp

θα κάνουν μια
I2G_MPI_APPLICATION_ARGS='A = 1 B = 2 G 123'

Ελπίζω να σε βοήθησα

Σε ευχαριστώ πολύ φίλε! Να'σαι καλά!

[Λήσταρχος Γιαγκούλας]

Καλησπερα, γνωρίζει κανείς αν στα linux της Βεργίνας μπορούμε να τρέξουμε  τοπικά mpi;

[TrueForce]

Αν θυμάμαι καλά, ναι, μπορείς.

[talkshowhost]

Για τη δεύτερη επιλογή, εχετε καταφερει να  βελτιωθει σημαντικα ο χρονος σε σχεση με την 3η εργασια ?
Με μονη αλλαγη  τα threads να έχουν προσβαση σε συνεχομενες θεσεις μνημης  ,
π.χ  για ν=2^10 ,p=0.33 στο 2ο kernel
έχω στην 3η εργασια χρονο 0.22 s,  ενώ στην 4η 0.19 s, και γενικα η βελτίωση στο χρόνο είναι αυτης της ταξης.