[Παράλληλα & Διανεμημένα] 2η εργασία

[Thmmy.gr portal]

  Thmmy.gr portal
   Forum
   Downloads
   Ενεργ. Λογαριασμού
   Επικοινωνία
  
  Χρήσιμα links
   Σελίδα τμήματος
   Βιβλιοθήκη Τμήματος
   Elearning
   Φοιτητικά fora
   Πρόγραμμα Λέσχης
   Πρακτική Άσκηση
   Ηλεκτρονική Εξυπηρέτηση Φοιτητών
   Διανομή Συγγραμμάτων
   Ψηφιακό Καταθετήριο Διπλωματικών
   Πληροφορίες Καθηγητών
   Instagram @thmmy.gr
   mTHMMY
  
  Φοιτητικές Ομάδες
   ACM
   Aristurtle
   ART
   ASAT
   BEAM
   BEST Thessaloniki
   EESTEC LC Thessaloniki
   EΜΒ Auth
   IAESTE Thessaloniki
   IEEE φοιτητικό παράρτημα ΑΠΘ
   SpaceDot
   VROOM
   Panther
  

THMMY.gr Web

Helios_MultiScribbles2SMF Default ThemeSMFone_Blue

[Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads]

Είσαι πρωτοετής;... Καλώς ήρθες! Μπορείς να βρεις πληροφορίες εδώ. Βοήθεια για τους καινούργιους μέσω χάρτη.

Κατεβάστε εδώ το Android Application για εύκολη πρόσβαση στο forum.

Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads με προσοχή στα ονόματα των αρχείων!

[12:00-13:30]

Η γραμματεία είναι ανοιχτή καθημερινά 12:00-13:30

[Salvation]

Μα στο ethmmy έλεγε το MPICH2 το κατεβάζετε από.... Αμα μας επιτρέπει openmpi noproblem

[SolidSNK]

Μα στο ethmmy έλεγε το MPICH2 το κατεβάζετε από.... Αμα μας επιτρέπει openmpi noproblem

Χμμ δεν το 'χα δει. Είχε αναφερθεί πάντως στο OpenMPI στο μάθημα. Σε αντίθεση με το mpich2, υπήρχε έτοιμο "επίσημο" πακέτο στη διανομή μου, οπότε το προτίμησα.

Πάντως, και τα δύο υποστηρίζουν windows. Δεν είναι απαραίτητο να προσπαθείτε με cygwin. Απ' όσο έχω δει ο κώδικας του kmeans είναι portable (δε χρησιμοποιεί υπηρεσίες unix λειτουργικού), οπότε ο cygwin είναι περιττός.

[nikos-v]

Μπορει καποιος να εξηγησει πως τρεχουμε mpi σε ubuntu,πως χρησιμοποιουμε δηλαδη την mpich κλπ κλπ...

[AgentCain]

πρωτα πρέπει να σιγουρευτείς ότι εχεις καποια mpi μεσα

αν γραψεις απλως mpirun και την εχεις, θα σου πει ότι δεν συνεταξες σωστά την εντολή
αν δεν την εχεις, τότε θα σου προτείνει το ίδιο να κανεις εγκατασταση ενα απο τα πακετα που προσφέρουν mpi

με sudo apt-get mpich2-1.3.1 βαζεις την mpich

από κει και πέρα χρησιμοποιείς το mpicc για να κανεις compile τον κωδικα σου (οπως εκανες πριν με το gcc)
και mpirun για να το τρεξεις. Στο mpirun πρεπει να βαλεις flag -np X όπου X ο αριθμός των διεργασιών που θα προσομοιώνουν τα MPI συστήματα

 

[tomshare3]

Μπορεί κάποιος να μου εξηγήσει τι ακριβώς γίνεται μεσα στο όρισμα της euclidean_distance?? ποια διανύσματα μεταφέρονται τελικα?? κολλάω στο οτι προσθέτει έναν pointer με εναν αριθμό... μετακινεί τη θέση του pointer για να κινηθεί μεσα στον πίνακα?? ή κατι αλλο? 

void kmeans_process(  ...  ){
 . . .

  for(i=0; i<data_in->secondary_dim; i++){
    tmp_dist = 0;
    tmp_index = 0;
    min_dist = FLT_MAX;
    /*find nearest center*/
    for(k=0; k<clusters->secondary_dim; k++){
      tmp_dist = euclidean_distance(dataset+i*data_in->leading_dim, centroids+k*clusters->leading_dim, data_in->leading_dim);
      if(tmp_dist<min_dist){
   min_dist = tmp_dist;
   tmp_index = k;
      }
    }
   
    . . .

[Salvation]

Ο dataset περιεχει τις συντεταγμένες των δεδομένων σου και ο centroid τις συντεταγμένες των κέντρων. Ο πρώτος πίνακας έχει μέγεθος numobjects*numattributes και ο 2ος numclusters*numattributes. Η συνάρτηση παίρνει ως όρισμα την διεύθυνση του πρώτου στοιχείου του dataset, τη διεύθυνση του πρώτου στοιχείου του centroids και το μέγεθος του διανυσματος. Με το να προσθέτει στους pointers ουσιαστικά πηγαίνει στο επόμενο στοιχείο του πίνακα.

[tomshare3]

thx! κάτι τέτοιο ψιλιάστηκα!!

[sarovios]

πρωτα πρέπει να σιγουρευτείς ότι εχεις καποια mpi μεσα

αν γραψεις απλως mpirun και την εχεις, θα σου πει ότι δεν συνεταξες σωστά την εντολή
αν δεν την εχεις, τότε θα σου προτείνει το ίδιο να κανεις εγκατασταση ενα απο τα πακετα που προσφέρουν mpi

με sudo apt-get mpich2-1.3.1 βαζεις την mpich

από κει και πέρα χρησιμοποιείς το mpicc για να κανεις compile τον κωδικα σου (οπως εκανες πριν με το gcc)
και mpirun για να το τρεξεις. Στο mpirun πρεπει να βαλεις flag -np X όπου X ο αριθμός των διεργασιών που θα προσομοιώνουν τα MPI συστήματα

 

την εντολη mpicc θα την χρησιμοποιησουμε στο make file?

[DoomGuard]

την εντολη mpicc θα την χρησιμοποιησουμε στο make file?

Ναι αντικαθιστάς την gcc me mpicc

[sarovios]

μετα απο αυτη την αλλαγη θα πρεπει να τρεχει?
βασικα εμενα δεν μου τρεχει ουτε το αρχειο οπως το κατεβαζω απο το e-thmmy.

[DoomGuard]

μετα απο αυτη την αλλαγη θα πρεπει να τρεχει?
βασικα εμενα δεν μου τρεχει ουτε το αρχειο οπως το κατεβαζω απο το e-thmmy.

Ναι εφόσον έχεις εγκαταστήσει σωστά τo MPICH2,

και το mpicc kai mpirun είναι στο PATH σου,

δηλαδή αν από terminal γράψεις mpicc και δεν σου βγάλει ότι δεν καταλαβαίνει ποια είναι αυτή η εντολή,

τότε αλλάζοντας το στο makefile  το gcc με mpicc δώσεις στο φάκελο την εντολή make , μετά το τρέχεις με ./kmeansTest

[Time_Tripper]

Παιδια μπορει να πει κανεις με ποια σειρα βαζουμε τα ορισματα στο τελικο compile? Βασικα το flag -np το βαζουμε πρωτο και μετα τα υπολοιπα (αριθμος στοιχειων, διαστασεις,clusters) ή το αντιθετο;

[AgentCain]

mpirun -np X ./kmeans XXXXX XX XX

Code:

 
  int numObjects = atoi(argv[1]);
  int numAttributes = atoi(argv[2]);
  int numClusters = atoi(argv[3]);

όπως βλέπεις, η σειρά ειναι αυτη που ειπες 

[Time_Tripper]

οκ το πιασα!!!! Thnx Alex!!!! 

[Salvation]

Μια ερώτηση σχετικά με το matlab. Εκανα import_data με τιμές 1000000 2 12 και μου εβγαλε τα κέντρα και το size του κάθε cluster. Επειδή δεν κατέχω από ματλαμπ γίνεται να μου πει κάποιος πως θα τα απεικονίσω αυτά όπως εκάνε και αυτός στο τελευταίο μάθημα;