[Παράλληλα και Διανεμημένα Συστ.] Εργασία 2

[Thmmy.gr portal]

  Thmmy.gr portal
   Forum
   Downloads
   Ενεργ. Λογαριασμού
   Επικοινωνία
  
  Χρήσιμα links
   Σελίδα τμήματος
   Βιβλιοθήκη Τμήματος
   Elearning
   Φοιτητικά fora
   Πρόγραμμα Λέσχης
   Πρακτική Άσκηση
   Ηλεκτρονική Εξυπηρέτηση Φοιτητών
   Διανομή Συγγραμμάτων
   Ψηφιακό Καταθετήριο Διπλωματικών
   Πληροφορίες Καθηγητών
   Instagram @thmmy.gr
   mTHMMY
  
  Φοιτητικές Ομάδες
   ACM
   Aristurtle
   ART
   ASAT
   BEAM
   BEST Thessaloniki
   EESTEC LC Thessaloniki
   EΜΒ Auth
   IAESTE Thessaloniki
   IEEE φοιτητικό παράρτημα ΑΠΘ
   SpaceDot
   VROOM
   Panther
  

THMMY.gr Web

Helios_MultiScribbles2SMF Default ThemeSMFone_Blue

[Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads]

Είσαι πρωτοετής;... Καλώς ήρθες! Μπορείς να βρεις πληροφορίες εδώ. Βοήθεια για τους καινούργιους μέσω χάρτη.

Κατεβάστε εδώ το Android Application για εύκολη πρόσβαση στο forum.

Ανεβάζετε τα θέματα των εξετάσεων στον τομέα Downloads με προσοχή στα ονόματα των αρχείων!

[Admins]

Για αλλαγή του public name σας, επικοινωνήστε με έναν από τους Admins.

[TrueForce]

Μπορεί να δώσει κανείς αναλυτικές οδηγίες για το πως να τρέξουμε MPI στον διαδη;

++

γενικα μπορεις να κανεις compile και να δες τα ερρος(αμα αυτο θες να κανεις και οχι να ελεγξεις γενικα τη λειτουργια του αλγοριθμου), αλλα δε θα τρεξει.

[jthois]

Το έχω κάνει compile και στο δικό μου υπολογιστή. Νόμιζα ότι μπορεί να τρέξει στο διάδη

[TrueForce]

Εχει οδηγιες στη 2η σελιδα βασικα. Ο διαδης κολαει η ειναι ιδεα μου/φταει το πισι μου;

[kofski17]

o διάδης μου κρασάρει εμένα όταν πάω να τρέξω το παράλληλό μου για q+p πάνω από 23. Επίσης το σειριακό της εκφώνησης κρασάρει επίσης στο διάδη αν δοκιμάσεις να βάλεις q γύρω στο 30 και πάνω.

Σχετικά με το δεγκριντ, έχω συνδεθεί κανονικά και αλλάξει το πασσ μου όπως υποδυκνείει στο ημαιλ που μας στείλανε, αλλά δεν μπορώ να βρώ πουθενά οδηγίες για το πως μεταφέρω τα αρχεία μου εκεί και πως τα τρέχω. Φαντάζομαι ότι μια εντολή scp από το command line όπως και στο διάδη θα είναι αλλά δεν μπορώ να βρω τη σύνταξή της. Επίσης το δεγκριντ έχει επανέλθει, δηλαδή λειτουργεί κανονικά πλέον??

στις οδηγίες που δίνει το ημαιλ λέει για τη μεταφορά αρχείων από και προς το server για Linux δείτε εδώ, και το εδώ γράφει απλά χρησιμοποιούμε τις εντολές scp από το terminal...

[Σα τανυστής]

Σχετικά με το δεγκριντ, έχω συνδεθεί κανονικά και αλλάξει το πασσ μου όπως υποδυκνείει στο ημαιλ που μας στείλανε, αλλά δεν μπορώ να βρώ πουθενά οδηγίες για το πως μεταφέρω τα αρχεία μου εκεί και πως τα τρέχω. Φαντάζομαι ότι μια εντολή scp από το command line όπως και στο διάδη θα είναι αλλά δεν μπορώ να βρω τη σύνταξή της. Επίσης το δεγκριντ έχει επανέλθει, δηλαδή λειτουργεί κανονικά πλέον??

στις οδηγίες που δίνει το ημαιλ λέει για τη μεταφορά αρχείων από και προς το server για Linux δείτε εδώ, και το εδώ γράφει απλά χρησιμοποιούμε τις εντολές scp από το terminal...

Μου λειτουργει κανονικα εμενα.

cd στο local φακελο σου, και μετα scp localfilename user@ui.afroditi.hellasgrid.gr:

μη ξεχασεις το : στο τελος

[TrueForce]

Παιδια, τωρα που θα τρεξουμε το προγραμμα στον διαδη(μπειτε ethmmy αν δεν ειδατε την ανακοινωση) εχει νοημα να κανουμε συγκριση με τον σειριακο;

[et3rn1ty]

Παιδια, τωρα που θα τρεξουμε το προγραμμα στον διαδη(μπειτε ethmmy αν δεν ειδατε την ανακοινωση) εχει νοημα να κανουμε συγκριση με τον σειριακο;

Εννοείς ότι μπορεί να έχεις πιο αργά αποτελέσματα? Δεδομένου ότι έχει μπόλικους πυρήνες και άρα μπορεί να τρέχει αρκετά processes ταυτόχρονα, νομίζω θα είναι πιο γρήγορο από τον σειριακό, αλλά όχι τόσο όσο στο grid.

[pikachu93]

Όταν τρέχω το πρόγραμμα στο grid μου βγάζει αυτό το error message:

error while loading shared libraries: libmpich.so.10: cannot open shared object file: No such file or directory

Δεν μπορώ να καταλάβω τι φταίει. Αν είχε κανείς παρόμοιο πρόβλημα...

[TrueForce]

Παιδια, τωρα που θα τρεξουμε το προγραμμα στον διαδη(μπειτε ethmmy αν δεν ειδατε την ανακοινωση) εχει νοημα να κανουμε συγκριση με τον σειριακο;

Εννοείς ότι μπορεί να έχεις πιο αργά αποτελέσματα? Δεδομένου ότι έχει μπόλικους πυρήνες και άρα μπορεί να τρέχει αρκετά processes ταυτόχρονα, νομίζω θα είναι πιο γρήγορο από τον σειριακό, αλλά όχι τόσο όσο στο grid.

δοκιμασα, και οντως μεχρι 8 tasks τρεχει μια χαρα.
μετα λογικα θα καθυστερει αρκετα

[TrueForce]

Καλησπέρα,

Παρατηρήσαμε ότι ένας αριθμός εργασιών που έχουν υποβληθεί στην υποδομή
του HellasGrid, ορίζουν απαιτήσεις σε πόρους, οι οποίες είναι δύσκολο ή
αδύνατο να ικανοποιηθούν από το σύστημα.

Παρακαλώ, σημειώστε τα εξής:

Ο αριθμός των nodes δεν θα πρέπει να υπερβαίνει τα 4.

Για κάθε “p”, θα μπορούσατε να υποβάλετε μία διαφορετική εργασία, καθώς
κάθε μία θα πρέπει να δεσμεύει διαφορετικό αριθμό processors.

Για 2^q random integers και q=[16:20], μπορείτε να υποβάλετε μία εργασία
χρησιμοποιώντας ένα από τα PBS commands που μπορείτε να βρείτε στο τέλος
αυτού του μηνύματος, για τον ορισμό των nodes και των processors per
node που θα χρησιμοποιούνται από την κάθε εργασία.

Εργασίες που δεν έχουν υποβληθεί ακολουθώντας την παραπάνω λογική, θα
μπορούσαν να ακυρωθούν (με την χρήση της εντολής “qdel” για τα
αντίστοιχα Job IDs) και να υποβληθούν εκ νέου, αφού εφαρμοσθούν οι
απαραίτητες τροποποιήσεις.


Μπορείτε να βρείτε συνημμένο το script submit.sh, το οποίο μπορεί να σας
φανεί χρήσιμο για την υποβολή των εργασιών σας.

Σημειώστε ότι έχουμε θεωρήσει ότι το εκτελέσιμο αρχείο σας ονομάζεται
bitonic.
Για να χρησιμοποιήσετε το συνημμένο script, θα χρειαστεί ενδεχομένως να
τροποποιήσετε τον κώδικά σας, ώστε να δέχεται την τιμή του “q” ως argument.

Για οποιαδήποτε απορία, πρόβλημα ή πρόταση μη διστάσετε να
επικοινωνήσετε μαζί μας στο scientific-computing@auth.gr .

Σας ευχόμαστε Καλά Χριστούγεννα!


Εκ μέρους του Γραφείου Επιστημονικών Υπολογιστικών Υπηρεσιών, ΚΗΔ ΑΠΘ,
Αλεξάνδρα Χαραλαμπίδου

Αυτό το email το στείλανε σε όλους; Εγώ δεν έχω χρησιμοποιήσει τον hellas grid ακομα. Για λιγότερα από 8 nodes μπορουμε να κάνουμε και στον διάδη μετρήσεις άμα είμαστε μόνοι....

[Eragon]

Καλησπέρα,

Παρατηρήσαμε ότι ένας αριθμός εργασιών που έχουν υποβληθεί στην υποδομή
του HellasGrid, ορίζουν απαιτήσεις σε πόρους, οι οποίες είναι δύσκολο ή
αδύνατο να ικανοποιηθούν από το σύστημα.

Παρακαλώ, σημειώστε τα εξής:

Ο αριθμός των nodes δεν θα πρέπει να υπερβαίνει τα 4.

Για κάθε “p”, θα μπορούσατε να υποβάλετε μία διαφορετική εργασία, καθώς
κάθε μία θα πρέπει να δεσμεύει διαφορετικό αριθμό processors.

Για 2^q random integers και q=[16:20], μπορείτε να υποβάλετε μία εργασία
χρησιμοποιώντας ένα από τα PBS commands που μπορείτε να βρείτε στο τέλος
αυτού του μηνύματος, για τον ορισμό των nodes και των processors per
node που θα χρησιμοποιούνται από την κάθε εργασία.

Εργασίες που δεν έχουν υποβληθεί ακολουθώντας την παραπάνω λογική, θα
μπορούσαν να ακυρωθούν (με την χρήση της εντολής “qdel” για τα
αντίστοιχα Job IDs) και να υποβληθούν εκ νέου, αφού εφαρμοσθούν οι
απαραίτητες τροποποιήσεις.


Μπορείτε να βρείτε συνημμένο το script submit.sh, το οποίο μπορεί να σας
φανεί χρήσιμο για την υποβολή των εργασιών σας.

Σημειώστε ότι έχουμε θεωρήσει ότι το εκτελέσιμο αρχείο σας ονομάζεται
bitonic.
Για να χρησιμοποιήσετε το συνημμένο script, θα χρειαστεί ενδεχομένως να
τροποποιήσετε τον κώδικά σας, ώστε να δέχεται την τιμή του “q” ως argument.

Για οποιαδήποτε απορία, πρόβλημα ή πρόταση μη διστάσετε να
επικοινωνήσετε μαζί μας στο scientific-computing@auth.gr .

Σας ευχόμαστε Καλά Χριστούγεννα!


Εκ μέρους του Γραφείου Επιστημονικών Υπολογιστικών Υπηρεσιών, ΚΗΔ ΑΠΘ,
Αλεξάνδρα Χαραλαμπίδου

Αυτό το email το στείλανε σε όλους; Εγώ δεν έχω χρησιμοποιήσει τον hellas grid ακομα. Για λιγότερα από 8 nodes μπορουμε να κάνουμε και στον διάδη μετρήσεις άμα είμαστε μόνοι....

Ναι το έστειλαν σε όλους...
Στο διάδη εγώ τουλάχιστον έκανα μετρήσεις μέχρι και για 128 nodes... Απλώς για 128 nodes και q=19 και 20 κολλάει αρκετά...
Στο hellasgrid μου έχουν δεχτεί μέχρι και για 64 (nodes*ppn)...

[TrueForce]

αρα τι παιζει; που θα κανουμε τις μετρησεις αμα στον χελλας δεν μπουρουμε να κανουμε πανω απο 4 νοντς;

[Eragon]

αρα τι παιζει; που θα κανουμε τις μετρησεις αμα στον χελλας δεν μπουρουμε να κανουμε πανω απο 4 νοντς;

στον χελλας μπορείς να κάνεις π.χ. 2 nodes *32 ppn... δεν ξέρω τι ακριβώς είναι τα nodes εν προκειμένω αλλά για να έχουν το πολύ 4 υποθέτω ότι δε μιλάμε για απλά PC. Μάλλον είναι συστοιχίες υπολογιστών, οπότε αν σου βγαίνει ο αριθμός που θες με nodes*ppn θα είσαι κομπλέ...και πράγματι μιλάμε για μια επιτάχυνση της τάξης του 30x σε σχέση με το σειριακό...

[vasl12]

να ρωτήσω κάτι? όταν γίνεται το initialize κάθε διεργασία πρέπει να έχει διαφορετικά στοιχεία  από τις άλλες ή οχι
Εμένα όλες αρχικοποιούν τα ίδια σημεία...

[vlad]

να ρωτήσω κάτι? όταν γίνεται το initialize κάθε διεργασία πρέπει να έχει διαφορετικά στοιχεία  από τις άλλες ή οχι
Εμένα όλες αρχικοποιούν τα ίδια σημεία...

Τυχαια.Μπορει να εχουν τα ιδια μπορει οχι. :Ρ