Erasmus-Mundus 2008 Seminar:
“From Molecular to Systems Biology and Biocomputing”
Leonidas Bleris, Harvard University
Μέσα στα πλαίσια του προγράμματος Erasmus-Mundus, έχει προσκληθεί ο Dr. Leonidas Bleris (email:
lbleris@cgr.harvard.edu) ερευνητής του Πανεπιστημίου Harvard των Ηνωμένων Πολιτειών. για να διεξάγει σεμινάριο σε βιολογικά συστήματα υπολογιστών. Το σεμινάριο θα γίνει στην αγγλική γλώσσα (περισσότερες πληροφορίες ακολουθούν), στην αίθουσα 8 του Τμήματος Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών, τις ημέρες και ώρες που αναφέρονται στο πρόγραμμα του σεμιναρίου που δίνεται παρακάτω.
Ο στόχος του σεμιναρίου είναι να παρουσιαστούν πρόσφατα ερευνητικά αποτελέσματα σχετικά με τη δημιουργία υπολογιστικών κυκλωμάτων μέσα σε ανθρώπινα κύτταρα και οι πιθανές εφαρμογές τους. Η πρώτη εβδομάδα θα αφιερωθεί στο υπόβαθρο που απαιτείται σε μοριακή βιολογία, γενετική μηχανική, εργαστηριακές πρακτικές και σε τεχνικές μοντελοποίησης βιομοριακών συστημάτων. Η δεύτερη εβδομάδα θα αφιερωθεί σε θέματα σχετικά με γενετική, βιοπληροφορική, θέματα «υψηλού» ερευνητικού ενδιαφέροντος (RNAi, microRNAs, stem cells). Την τρίτη εβδομάδα θα γίνει εισαγωγή στα βιοϋπολογιστικά συστήματα., θα παρουσιαστούν υλοποιήσεις υπολογιστικών κυκλωμάτων σε βακτηριδιακά και ανθρώπινα κύτταρα και οι πιθανές εφαρμογές τέτοιων συστημάτων.
Όποιος ενδιαφέρεται να παρακολουθήσει το σεμινάριο παρακαλείται να δηλώσει συμμετοχή στέλνοντας ηλεκτρονικό μήνυμα στη διεύθυνση:
mkour@auth.gr ή τηλεφωνώντας στη κα Μαρία Κουρκουλή στο 9-5922. Ο γενικός σχεδιασμός για το περιεχόμενο του σεμιναρίου ακολουθεί, αλλά οι παρουσιάσεις θα προσαρμοστούν ανάλογα με τις ανάγκες
General Title: "From Molecular to Systems Biology and Biocomputing”
1st Week – Molecular Biology and Genetic Engineering
• Lecture 1 (3/3, 3-5μμ): Introduction to genetic engineering and molecular biology
DNA, RNA, miRNA, genes, gene expression, and genome
• Lecture 2 (4/3, 3-5μμ): Experimental techniques
DNA/RNA Isolation, gel electrophoresis, sequencing, enzymes
• Lecture 3 (6/3, 3-5μμ): From the techniques to organisms
Vector systems, cloning strategies, polymerase chain reaction,
selection and measurements
2nd Week – Systems Biology
• Lecture 4 (12/3, 3-5μμ): Genomics and bioinformatics
High throughput techniques, DNA microarrays
• Lecture 5 (13/3, 3-5μμ): Current research and applications
RNAi/MicroRNAs, synthetic biology, stem cells, gene therapy, genotyping
3rd Week – Biocomputin
• Lecture 6 (17/3, 3-5μμ) Biodevices and computation in cells Logic gates, oscillators
• Lectures 7 and 8 (18 and 19 /3, 3-5μμ): Building logic circuits in human cells. If necessary an additional lecture will be scheduled (20th or the 22nd).