THMMY.gr

     http://folding.stanford.edu/ (http://folding.stanford.edu/)

     Μπορείς να συμβάλλεις από το σπίτι στην εύρεση θεραπείας για τον Καρκίνο

     Το πρόγραμμα Destributed Computing, Folding@Home, αξιοποιεί τον υπολογιστή σου όταν αυτός βρίσκεται σε idle κατάσταση για έναν ευγενή σκοπό. Το πρόγραμμα το οποίο μπορεί ο καθένας να κατεβάσει έχει πάντα lowest priority και εκτελεί, με τη βοήθεια των χρηστών που συμμετέχουν, πολύπλοκες προσομοιώσεις οι οποίες συμβάλλουν στη σχεδίαση φαρμάκων και την κατανόηση και θεραπεία ασθενειών όπως ο Καρκίνος, το Alzheimer, το Parkinson κ.α. Όταν τελειώσει η εργασία στον υπολογιστή του κάθε χρήστη τα δεδομένα στέλνονται μέσω internet.
      Συμμετέχουν 1.000.000 CPUs σε όλον τον κόσμο, συνθέτοντας συνολικά έναν από του ισχυρότερους super computer του κόσμου και όλα αυτά στην υπηρεσία της επιστήμης. Διαβάστε πιο πολλά στην ιστοσελίδα του προγράμματος.

CURRENT PROJECTS AND PROGRESS TO DATE:
•   Alzheimer's Disease
•   Cancer
•   Huntington's Disease
•   Osteogenesis Imperfecta
•   Parkinson's Disease
•   Ribosome & antibiotics
Your participation can help lead to a cure for these diseases.

What is protein folding and how is folding linked to disease?
Proteins are biology's workhorses -- its "nanomachines." Before proteins can carry out these important functions, they assemble themselves, or "fold." The process of protein folding, while critical and fundamental to virtually all of biology, in many ways remains a mystery.

Moreover, when proteins do not fold correctly (i.e. "misfold"), there can be serious consequences, including many well known diseases, such as Alzheimer's, Mad Cow (BSE), CJD, ALS, Huntington's, Parkinson's disease, and many Cancers and cancer-related syndromes.

You can help by simply running a piece of software. Folding@Home is a distributed computing project -- people from through out the world download and run software to band together to make one of the largest supercomputers in the world. Every computer makes the project closer to our goals.

Folding@Home
uses novel computational methods coupled to distributed computing, to simulate problems thousands to millions of times more challenging than previously achieved.

Γνωρίζεις μήπως αν τα συμπεράσματα που βγαίνουν από το μοιραζόμενο CPU τίθονται υπό καθεστώς πατέντας?

Δεν έχω χρόνο τώρα να το ψάξω (αργότερα θα το κάνω λογικά) αλλά μήπως έχεις βρει κάποια πληροφορία για το αντίθετο..?

Ελπίζω τα κίνητρα του Στάνφορντ και της έρευνας αυτής να είναι επιστημονικά/ανθρωπιστικά και να μην υπάρχουν εταιρίες χρηματοδότες που θα τους ανήκουν τέτοιες πατέντες.



Οι πατέντες στις φαρμακοβιομηχανίες είναι από τα πιο φρικτά πράγματα στον κόσμο....



Ωραίο πάντως #Kronokid# :)

Εγώ πάντως το έβαλα στον server που τον έχω μόνο να κατεβάζει... και συνήθως δεν κάνει τίποτα.

Άντε, βάλτε όλοι να κάνουμε την Θεσσαλονίκη κόκκινη βουλιτσα!!!

      Δεν γνωρίζω αν πωλούνται σε φαρμακοβιομηχανίες τα αποτελέσματα που αφορούν τα αντιβιοτικά. Είδα όμως πλούσιες δημοσιεύσεις απο αυτό το πρόγραμμα. Προσπαθούν να εξηγήσουν, από οτι κατάλαβα, την αναδίπλωση των πρωτεϊνών έτσι ώστε να εξηγήσουν τους μηχανισμούς που οδηγούν σε λανθασμένη αναδίπλωση και προκαλούν σοβαρές ασθένειες.
      Κατά τη γνώμη μου πάντος είναι πολύ ελπιδοφόρα προσπάθεια να βρεθούν οι μηχανισμοί που προκαλούν τον καρκίνο, το Parkinson και το Alzheimer, ασθένειες οι οποίες καλύπτονται από ένα πέπλο μυστηρίου καθώς πολύ λίγα είναι γνωστά για αυτές. Ακόμα κι αν τα δικαιώματα εκμετάλλευσης της γνώσης πωληθούν, η πρόοδος είναι καλύτερη από τη στασιμότητα. Το ιδανικό είναι βέβαια η γνώση αυτή να είναι ελεύθερη, αλλά δεν ξέρω αν κάτι τέτοιο συμβαίνει ή οχι.

       Ένα ενδιαφέρον στοιχείο είναι ότι οι συμμετέχοντες μπορούν να οργανώνονται σε ομάδες και να παίρνουν πόντους ανάλογα με την προσφορά τους.
       Ανάμεσα στις top 100 ομάδες όσον αφορά το score είναι και το PC Magazine Greek edition me 735 μέλη και μια κοινότητα η Hellas@Folding me 395 μέλη.
        Δεν θα ήταν καλή ιδέα να συμμετείχαμε ως forum ηλεκτρολόγων;;;

Είναι πράγματι φρικτές αυτές οι πατέντες... Αλλά είναι μέρος ενός φρικτό πολιτικού συστήματος σε έναν φρικτό κόσμο..

Οπότε από το να μην ανακαλυφθεί τίποτα, καλύτερα να ανακαλύψουν κάτι, κι ας είναι και κωλοεταιρίες. Μπορεί κάποτε να φανεί χρήσιμο...

---

Οπότε αν έχουμε κανένα pCάκι, όλη μέρα ανοικτό και idle (όπως του λόγου μου καλή ώρα), δεν χάνουμε τίποτα να το βάλουμε μπρος...

      Είπα να βάλω έναν πιο πιασάρικο τίτλο για να τραβήξουμε την προσοχή!

Πολύ ενδιαφέρον το θέμα, όντως! Εγώ πρώτη φορά έβαλα το folding@home πριν από 4 χρόνια και άφηνα το PC ανοιχτό τα βράδια για να ...διπλώνει πρωτεΐνες. Δυστυχώς δεν έχουν βγάλει ακόμα native intel έκδοση για τον Mac, οπότε προς το παρόν το έχω αφήσει.

Στην ίδια λογική είναι και το διάσημο SETI@Home, που αναλύει τα ραδιοκύματα που λαμβάνονται από το διάστημα για ενδεχόμενα εξωγήινα σήματα! (όπως στην ταινία Contact ένα πράμα...)

Συμφωνώ ότι από το να μη βρεθεί τίποτα καλύτερα να βρεθεί κάτι.

Απλά δε μπορώ να μην αναφέρω ότι μέχρι να λήξει η πατέντα των ρετροϊκών (?) φαρμάκων κατά του AIDS, εκατομύρια άνθρωποι θα πεθαίνουν αβοήθητοι, και ουσιαστικά δεν υπάρχει και ελπίδα να βρεθεί κάτι αντίστοιχο, αφού είναι πατενταρισμένο.



ΟΙ ΠΑΤΕΝΤΕΣ ΦΑΡΜΑΚΩΝ ΕΙΝΑΙ ΕΜΠΟΡΙΟ ΘΑΝΑΤΟΥ...



θα το κατεβάσω με την πρώτη ευκαιρία (πόσο μεγάλο είναι αυτό αλήθεια και πόσο συχνά θέλει επικοινωνία με τον σέρβερ?) αλλά γενικότερα θεωρώ ότι πρέπει να είμαστε προσεκτικοί όταν προσφέρουμε υπηρεσίες σε ποιόν τις προσφέρουμε.
Άλλο να βοηθάς και άλλο να βγάζουν χρήμα κάποιοι από εσένα. και κυρίως με τον επαίσχυντο τρόπο που ανέφερα.



(τι λέει, θα την κάνουμε την ομάδα?)

Να προσθεσω πως πλεον οσοι εχουν ΑΤΙ καρτες γραφικων μπορουν να τις χρησιμοποιησουν στο Folding@Home "προσφέροντας 30 φορές υψηλότερες επιδόσεις σε σχέση με τον... ταχύτερο Core 2 Duo της Intel"

Το αρθρο ειναι εδω http://tech.pathfinder.gr/IT/news/221454.html

Την Παρασκευή 29 Σεπτεμβρίου η ATI ανακοίνωσε την τεχνολογία Stream Computing, μια μέθοδο όπου η κάρτα γραφικών μπορεί να χρησιμοποιηθεί σαν συν-επεξεργαστής, και να εκτελέσει επιτάχυνση μαθηματικών αλγορίθμων. Τo Folding@Home είναι η πρώτη εφαρμογή που χρησιμοποιεί την τεχνολογία αυτή, προσφέροντας 30 φορές υψηλότερες επιδόσεις σε σχέση με τον... ταχύτερο Core 2 Duo της Intel! Το Stream Computing event της ATI έγινε στο San Francisco και το PC World ήταν εκεί. Την παρουσίασε έκανε ο ίδιος ο CEO της ATI, Dave Orton, ενώ για το κομμάτι του Folding@Home μίλησε ο διευθυντής του προγράμματος του πανεπιστημίου του Standford, Vijay Pande.

Σύμφωνα με τα λεγόμενα λοιπόν των δυο, το Folding@Home, με ένα καινούριο client που θα είναι διαθέσιμος από το site του Standford (http://folding.stanford.edu/download.html) σε μερικές ώρες, οι χρήστες θα μπορούν να επιταχύνουν την σύνθεση των πρωτεϊνών για την εύρεση θεραπειών σε διάφορες χρόνιες ασθένειες (αλζχάιμερ, καρκίνο κ.α.) χρησιμοποιώντας την κάρτα γραφικών τους! Υποστηρίζονται κάρτες της σειράς X1900, με την X1900XT να προσφέρει επιδόσεις σχεδόν 30 φορές υψηλότερες σε σχέση με τον ταχύτερο Core 2 Duo επεξεργαστή! Το Stanford μάλιστα αναμένει να αποκτήσει υπολογιστική ισχύ της τάξης του 1Petaflop, αν 10.000 -από το σύνολο των 2 εκατομμυρίων χρηστών- διαθέτουν τέτοιες κάρτες, κερδίζοντας 29 χρόνια σε επεξεργασία δεδομένων (1 χρόνος αντί για 30, για συγκεκριμένα δεδομένα)! Αν λοιπόν είστε κάτοχος μιας τέτοιας κάρτας, κατεβάστε τον client και βοηθήστε την επιστήμη να λύσει τα μυστήρια των παραπάνω ασθενειών! (Δείτε το Βίντεο: http://www.youtube.com/watch?v=cGzCmv7A0NE)

      Είναι απόλυτα σωστή η παρατήρησή σου Turambar! Με απασχολεί κι εμένα αυτό που θίγεις.
      Κατά τα άλλα το πρόγραμμα είναι 372K και από όσα γνωρίζω επικοινωνεί με τον server μια φορά στην αρχή για να πάρει τα δεδομένα και μια φορά στο τέλος του λεγόμενου WU (work unit). Η επεξεργασία του οποίου μπορεί να διαρκέσει στο σύνολο 3 μέρες ανάλογα με τον επεξεργαστή σου. Στο τέλος της εργασίας επικοινωνεί με τον server όταν μπεις στο internet. Στο μεσοδιάστημα δεν χρειάζεται να είσαι καν στο internet.

Γράφτηκα και εγώ :)


για την ιστορία ψάχνοντας λίγο βρήκα το εξής:

Who "owns" the results? What will happen to them? Unlike other distributed computing projects, Folding@home is run by an academic institution (specifically the Pande Group, at Stanford University's Chemistry Department), which is a nonprofit institution dedicated to science research and education. We will not sell the data or make any money off of it.

Moreover, we will make the data available for others to use. In particular, the results from Folding@home will be made available on several levels. Most importantly, analysis of the simulations will be submitted to scientific journals for publication, and these journal articles will be posted on the web page after publication. Next, after publication of these scientific articles which analyze the data, the raw data of the folding runs will be available for everyone, including other researchers, here on this web site.


Τι είναι το Pande Group?

το σάιτ δε λέει πολλά.


πάντως θα συνεχίζω να το ψάχνω μόνο και μόνο επειδή μου μπήκε η ιδέα (όχι ότι αμφιβάλλω ιδιαίτερα απλά κάπως πρέπει να εξασφαλίζονται οι χρήστες όταν προσφέρουν τους πόρους τους)



Αλήθεια κύβε, πρέπει να ολοκληρώσουμε κάτι για να μας γράψουν εδώ:
http://fah-web.stanford.edu/teamstats/team52302.html
?


άντε να γραφόμαστε :)

τι είναι το σκριν σέηβερ που βγάζει?


About the screen saver

Our screen saver shows real time visualizations of the simulations being performed. The molecule drawn is the current atomic configuration ("fold") of the protein being simulated on your computer and the pie chart the left shows the current progress on the work unit.

There are currently four visualization modes: Space-filling, ball-and-stick, wireframe, and alpha-trace. In ball-and-stick, each small ball represents an atom, and the sticks represent bonds between atoms. In the space-filling model, each filled sphere represents the approximate volume that the electrons occupy around each atom. In wireframe mode, only the bonds are drawn, but with the vertices colored to indicate atom identity. In all but alpha-trace mode, carbon atoms are drawn in dark gray, hydrogen atoms are drawn in light gray (although some hydrogen atoms are not drawn at all), oxygen atoms are drawn in red, nitrogen atoms are drawn in blue, and sulfur atoms are drawn in yellow. In the alpha-trace model, only one atom (the alpha-carbon) is shown per amino acid residue, in order to emphasize the overall arrangement of the peptide or protein.

Σε μένα πάντως, επειδή το τρέχω με Win2003 Server, μόλις ανοίγω το screen saver, κολάει το πρόγραμμα...  :-\

Τα post που αφορούν στην ομάδα 52302 (thmmy.gr Force) μεταφέρθηκαν εδώ...

Folding@Thmmy.gr (http://www.thmmy.gr/smf/index.php?topic=10208.0)


Κ.Ι.Σ.